Os sacerdotes incas parecem ter sido mais importantes no começo do Império, quando tinham cargos importantes e tentaram se apoderar da administração. Derrotados pelos nobres, eles tiveram que abrir mão de seus privilégios, entre eles, o de dar acesso ao povo à sua profissão.

O pontífice dos sacerdotes era Villca Humu, irmão ou primo do Inca. Ele devia ser celibato, mas acredita-se que tinha concubinas. Ele só se alimentava de ervas, bebia unicamente água e fazia jejum oito dias seguidos. Vivia no campo, perto de Cuzco e vestia uma túnica de lã, comprida até os tornozelos, e uma manta cinza, marrom ou preta.

Nas cerimônias, Villca Humu se cobria com uma manta branca e se enfeitava com um peitoral de ouro em forma de meia lua, com braceletes e pulseiras de ouro com uma tiara do mesmo metal, onde figurava o símbolo solar.

O pontífice era o juiz supremo de todo o religioso e presidia um Conselho formado por oito ou dez altos sacerdotes. Acredita-se que ele nomeava o alto clero que por sua vez designava o subalterno.

Os sacerdotes comuns eram os hatun villca, encarregados do culto e dos sacrifícios. Todos os dias, ao amanhecer, matavam uma lhama branca no seu templo. Depois de o animal ser degolado, eles lhe arrancavam o coração e os pulmões e espalhavam com o seu sangue a imagem do Sol. Se o ritual não fosse realizado com cuidado, poderia provocar grandes males, como secas ou chuvas torrenciais.